农作物种质资源是现代种业发展的战略性资源，地方特色农作物种质资源是农业种源的核心组成部分，常常具有明显的特征和稳定的性状，是选育农作物新品种的基础材料。通过分析上海市第三次农作物种质资源普查数据，发现上海市在地方特色农作物种质资源的保护和开发利用上取得了一定成绩，但整体还不能满足本市现代农业发展的需求，还存在着地方特色种质资源品种退化、种质资源优势基因发掘利用能力不足、种质资源鉴定评价没有规范化程序和标准以及种质资源保护利用资金不足等问题。通过问题分析和对策研究，以期探索出一条适合上海市发展的地方特色农作物种质资源保护和开发利用之路。