蓖麻 PIP5K1 基因克隆、生物信息学及功能分析
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1内蒙古民族大学生命科学与食品学院;2内蒙古自治区蓖麻育种国家民委重点实验室 / 内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室 / 蓖麻产业技术创新内蒙古自治区工程研究中心 / 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心

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    蓖麻 PIP5K1 基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用。为探究蓖麻 PIP5K1 基因在蓖麻物种中的生物学功能和不同时期雌性植株中的表达情况,以 aLmAB2 品系的蓖麻花序为试验材料,克隆 PIP5K1 基因,对该基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,并对 PIP5K1 基因在不同时期雌性系植株的表达模式进行分析。结果表明:从蓖麻花序轴顶端将总 RNA提取出来,并将其反转录成 cDNA,克隆后得到一个全长为 2325bp 的 PIP5K1 基因片段,经测序后比对这一基因序列和 NCBI参考基因序列相同。对该基因所编码蛋白展开生物信息学分析,确定 PIP5K1 基因所编码蛋白质的氨基酸等电点为 8.85,氨基酸数目为 774,分子量大小为 87967.37Da,是一种亲水性稳定蛋白;无跨膜螺旋区,属于非跨膜蛋白;蛋白质二级结构由 α 螺旋、β 转角、伸展链及无规卷曲构成;三级结构与二级结构预测结果一致;与同属于大戟科的木薯亲缘关系较近,与其他科亲缘关系较远。qRT-PCR 分析表明,PIP5K1 在标雌系、单雌系、两性系花序中均有不同程度的上调和下调,推测 PIP5K1 基因参与蓖麻花序发育的调控。本研究为探究 PIP5K1 基因促进蓖麻植株的生长发育机制奠定了理论基础。

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引用本文

李明静,袁朴芳,罗 蕊,尹明达,王志妍,户雪妹,顾晓慧,黄风兰.蓖麻 PIP5K1 基因克隆、生物信息学及功能分析.中国种业,2024(1):88-94

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  • 收稿日期:2023-11-03
  • 最后修改日期:2023-11-17
  • 录用日期:2023-11-17
  • 在线发布日期: 2024-01-04
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