种业振兴背景下，实现种业高质量发展的关键在于破解种业“卡脖子”问题，根本在于种子企业的创新发展。基于国泰安数据库与 15 家种业企业公开年报中的数据，运用模糊集定性比较分析法（fsQCA），研究了研发投入占比、企业规模、存货占比、研发人员占比、种企发展速度等对种企创新能力的联动效应。结果表明：单一的变量与种企科技创新能力间不存在必要条件，种企科技创新能力提高是多种变量间组合作用的结果，其原因是多样化的。对此，存在 3 种条件组态的种企科技创新提升路径，种企规模与研发投入占比条件出现多重并发，成为驱动种企科技创新的多样化组态；种企自主创新能力的提升推动种业振兴。建议我国种企应该并购重组扩大市场规模、整合优质资源，增加研发投入与研发人员数量以加快基础原始创新突破，完善相关种质种源法案以保护品种创新。