农业种质资源是农业科技原始创新与现代种业发展的物质基础，是支撑农业高质量、可持续发展的战略性重要资源之一。云南位于全球3大生物多样性最丰富的区域，是享誉世界的天然农业基因宝藏，具有许多极其珍贵的生物特有属和种。本文系统分析了云南农业种质资源保护利用现状及成效，找出了全省资源家底不清、资源保存与鉴定设施差、特有资源消失风险加剧、优异资源发掘利用滞后、资源引进输出情况不明、有效交流与共享不畅等存在的问题，并重点围绕加强农业种质资源的普查收集、保存保护、鉴定评价、开发创制、育种利用、交流合作等方面提出了系列对策建议。