公益性的科研院所和高等院校与其所办的种子企业脱钩是事业单位分类改革的大势所趋，是建设现代种业体系的必然选择，主要目的是打造科技型种子企业。可以通过引入社会资本改制重组，变更经营内容，注销或者转让全部股权等方式实现脱钩。在脱钩过程中要注意选择恰当的改制方式，履行审核审批程序，确定合理的资产评估方法，妥善解决职工安置等问题。