棉花种业的可持续发展，对维护我国棉花生产安全极为重要。提高我国棉花种业竞争力，坚持市场化构建种业发展长效机制，是棉花种业稳定发展的重要内容。在战略上应遵循“创新品种、提高种子质量、规范市场、打造品牌、合作发展、促进育繁推一体化”思路，建立技术创新战略、建立营销战略，促进种业的健康可持续发展，需要建立支持种业稳定可持续发展的长效机制。包括提高棉花种业增长后劲和增值增效的能力，提高棉花种业适应开拓创造市场的能力，提高棉花种业研发生产销售服务产品的能力，最终促进我国棉花种业国际竞争力的提升。