分析了我国农业科研单位种子企业的优势和存在的不足,针对目前存在的企业管理体制不合理、内部管理不科学、企业人员结构单一、市场意识不强、法制意识淡薄、新品种的研发完全依赖主办公司的科研单位、自主创新能力不高等方面的问题,提出了6方面应对措施:事企分设,建立独立法人的公司治理结构;改善内部管理水平,建立现代企业制度:建立人才激励机制,理顺分配关系;加大科研投入,增强企业自主创新能力;依法加强种子产业体系建设;完善财务管理,自觉依法纳税。