纤毛鹅观草原变种与竖立鹅观草变种在我国广泛分布，是重要的小麦族野生种质资源。为了研究种间和居群间的染色体变异和遗传多样性，本研究对15份材料进行核型参数差异分析，发现所有材料均为中部着丝点染色体或近中部着丝点染色体，具两对随体染色体分别为Ⅰ St和V Y；平均臂比的变化范围为1.21-1.40；染色体长度比的变化范围为1.59-1.80；核不对称系数为0.51-0.62，核型类型均为2A。基于荧光原位杂交（FISH）的核型分析共发现 61个FISH信号变异，其中 Y 染色体的变异（33）大于 St 染色体（28），构建居群间的“核心FISH核型”能对14对染色体进行区分。结果表明纤毛鹅观草原变种与竖立鹅观草变种居群在细胞核型数据和（FISH）核型上均存在丰富的多样性。