本文选取代表我国种业先进水平的种业上市公司投入与产出数据，运用Malmquist-DEA方法对我国种业上市公司的生产效率问题进行了研究。研究结果发现：种业上市公司总体上呈现快速发展趋势，其全要素生产率不断增长。技术进步是影响全要素生产率的最主要因素，规模无效性是种业技术效率的最主要制约因素。今后，我国种业上市公司的发展方向最关键的是是要促进技术进步和提高规模效率。