探索分析了我国种子科研机构建设和人才发展、种子科研水平和技术发展、种子品种研发的基本情况，并对我国近9年来主要囯审种子品种进行了较为详细地研究分析；通过11个种子科研因素的对比分析，显示了我国与发达国家之间种子科研差距；我国种子科研面临国外先进的种子科研理论和方法、品种数量和品质优势等方面的挑战，尤其是面临国外企业向我国种子科研育种延伸和渗透威胁和冲击；我国种子科研存在综合能力较弱、种子科研投入较少、知识产权保护不到位、种子科研资源优化难、种子及技术科技创新少、深层次的文化及环境不给力、种子企业暂难胜任商业育种创新的主体、我国农业科研院所转型难度大等诸多内部困境。我国只有克服和解决内部各种困扰，政府给予政策支持，加速种子科研转型，以市场为导向，优化配置科研资源，建立种子科研平台和大型研究中心，提高品种创新能力，才能增强种子科研竞争力。