通过对科研院所和种子企业的实地调研发现，种子企业与科研机构开展了品种经营权转让、共同开展育种研发、引进育种人才和种质资源等多种模式的合作，促进了一批优良品种、种质资源和育种人才流向种子企业。但种业科企合作还存在着品种经营权转让不规范、种质资源共享不足、科研人员流动机制不畅、国家育种科研投入错位等突出问题，需要进一步深化种业体制机制改革，加强种业知识产权保护，促进种业产学研结合，从而实现种子企业自主创新能力的提升。