我国种子产业管理体系主要由种子产业监管体系、种子协会自律体系、种子企业质量管理体系以及保障体系四个子体系构成。其中种子产业监管体系主要由国家级、省级、市地级等构成，分为决策层和执行层，目前执行层面的执行力问题较为突出；种子协会自律体系主要由国家级、省级、市地级、县级以及不同种子类别的种子协会构成，虽然协会组织基本建立，但基本未发挥其职能作用；种子企业质量管理体系主要由组织、质量制度、质量检验、制种基地、制种过程、种子贮藏加工、种子营销等管理构成；种子产业保障体系包括政策法规体系、产业保险体系、种业基金等。各体系作用的有效发挥对种子产业的发展具有至关重要的推动作用。